Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC59Q9P031 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC59Q9P031 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms