Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EHD2Q9NZN4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EHD2Q9NZN4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EHD2Q9NZN4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms