Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCH5Q9NX47 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH5Q9NX47 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH5Q9NX47 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms