Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVT9

ARMC1, Armadillo repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC1Q9NVT9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARMC1Q9NVT9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARMC1Q9NVT9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms