Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZCCHC3Q9NUD5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms