Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FOXD4L1Q9NU39 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4L1Q9NU39 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms