Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC13Q9NSE7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC13Q9NSE7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms