Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms