Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
C8orf17Q9NRJ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C8orf17Q9NRJ1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms