Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA2

SLC17A5, Sialin, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A5Q9NRA2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC17A5Q9NRA2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC17A5Q9NRA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC17A5Q9NRA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC17A5Q9NRA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC17A5Q9NRA2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms