Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC52A3Q9NQ40 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC52A3Q9NQ40 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC52A3Q9NQ40 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms