Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARFGAP3Q9NP61 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGAP3Q9NP61 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms