Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRHQ9HD43 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRHQ9HD43 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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