Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4F12Q9HCS2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4F12Q9HCS2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms