Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAT1LQ9HCJ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VAT1LQ9HCJ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms