Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP29Q9HBJ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP29Q9HBJ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms