Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH5

RDH14, Retinol dehydrogenase 14, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH14Q9HBH5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH14Q9HBH5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDH14Q9HBH5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH14Q9HBH5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms