Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRDE2Q9H7Z3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRDE2Q9H7Z3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRDE2Q9H7Z3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms