Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCAD1Q9H4L7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCAD1Q9H4L7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms