Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH19Q9H159 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH19Q9H159 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms