Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NYXQ9GZU5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NYXQ9GZU5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NYXQ9GZU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NYXQ9GZU5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms