Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ZC3H12CQ9C0D7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms