Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXQ1Q9C009 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXQ1Q9C009 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXQ1Q9C009 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms