Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NLRP1Q9C000 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NLRP1Q9C000 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms