Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM3Q9BZQ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDEM3Q9BZQ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms