Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BCO2Q9BYV7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms