Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM55Q9BYV6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM55Q9BYV6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms