Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL4Q9BYD3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms