Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIFC1Q9BW19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIFC1Q9BW19 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIFC1Q9BW19 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms