Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RTKNQ9BST9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms