Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYM1Q9BRP8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYM1Q9BRP8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYM1Q9BRP8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYM1Q9BRP8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYM1Q9BRP8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYM1Q9BRP8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYM1Q9BRP8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYM1Q9BRP8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYM1Q9BRP8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYM1Q9BRP8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYM1Q9BRP8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYM1Q9BRP8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms