Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT3Q9BQG1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT3Q9BQG1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms