Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3GL3Q99963 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL3Q99963 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3GL3Q99963 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL3Q99963 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL3Q99963 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL3Q99963 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL3Q99963 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL3Q99963 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL3Q99963 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL3Q99963 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL3Q99963 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms