Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3GL2Q99962 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3GL2Q99962 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms