Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGPAT1Q99943 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGPAT1Q99943 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms