Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC1Q99614 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC1Q99614 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms