Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRBNQ96SW2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CRBNQ96SW2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRBNQ96SW2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRBNQ96SW2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRBNQ96SW2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRBNQ96SW2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRBNQ96SW2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CRBNQ96SW2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRBNQ96SW2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRBNQ96SW2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms