Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KC1Q96S38 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KC1Q96S38 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KC1Q96S38 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms