Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PHF12Q96QT6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF12Q96QT6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms