Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCEEQ96PE7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCEEQ96PE7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCEEQ96PE7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms