Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA13Q96N96 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA13Q96N96 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms