Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNPC3Q96LT9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
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