Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMX3Q96JJ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMX3Q96JJ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms