Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A3Q96HJ5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms