Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPNQ96H22 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPNQ96H22 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPNQ96H22 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms