Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMT2BQ96GJ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT2BQ96GJ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms