Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBGCP3Q96CW5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms