Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM4SF18Q96CE8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TM4SF18Q96CE8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM4SF18Q96CE8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms