Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTI1AQ96AJ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1AQ96AJ9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms