Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLUAP1Q96AJ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLUAP1Q96AJ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLUAP1Q96AJ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms